Python 包介绍

本文档提供了 xgboost Python 包的基本演练。Python 包由 3 种不同的接口组成,包括原生接口、scikit-learn 接口和 dask 接口。有关 dask 接口的介绍,请参阅 使用 Dask 的分布式 XGBoost

其他有用链接列表

目录

安装 XGBoost

要安装 XGBoost,请按照 安装指南 中的说明进行操作。

要验证您的安装,请在 Python 中运行以下代码

import xgboost as xgb

数据接口

XGBoost Python 模块能够加载多种不同类型的数据格式,包括 CPU 和 GPU 数据结构。有关支持的数据类型的完整列表,请参考 XGBoost 各类函数支持的数据结构。有关文本输入格式的详细说明,请访问 DMatrix 的文本输入格式

输入数据存储在 DMatrix 对象中。对于 sklearn 估计器接口,根据选择的算法和输入,会创建一个 DMatrixQuantileDMatrix 对象,详情请参阅 sklearn API 参考。这里我们将使用 DMatrix 来演示一些基本的输入类型。

  • 将 NumPy 数组加载到 DMatrix

    data = np.random.rand(5, 10)  # 5 entities, each contains 10 features
    label = np.random.randint(2, size=5)  # binary target
    dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label)
    
  • scipy.sparse 数组加载到 DMatrix

    csr = scipy.sparse.csr_matrix((dat, (row, col)))
    dtrain = xgb.DMatrix(csr)
    
  • 将 Pandas 数据帧加载到 DMatrix

    data = pandas.DataFrame(np.arange(12).reshape((4,3)), columns=['a', 'b', 'c'])
    label = pandas.DataFrame(np.random.randint(2, size=4))
    dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label)
    
  • DMatrix 保存到 XGBoost 二进制文件会使加载更快

    dtrain = xgb.DMatrix('train.svm.txt?format=libsvm')
    dtrain.save_binary('train.buffer')
    
  • DMatrix 构造函数中,缺失值可以被默认值替换

    dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label, missing=np.NaN)
    
  • 需要时可以设置权重

    w = np.random.rand(5, 1)
    dtrain = xgb.DMatrix(data, label=label, missing=np.NaN, weight=w)
    

执行排序任务时,权重数量应等于组数。

  • 将 LIBSVM 文本文件或 XGBoost 二进制文件加载到 DMatrix

    dtrain = xgb.DMatrix('train.svm.txt?format=libsvm')
    dtest = xgb.DMatrix('test.svm.buffer')
    

    XGBoost 中的解析器功能有限。使用 Python 接口时,建议使用 sklearn 的 load_svmlight_file 或其他类似工具,而非 XGBoost 内置的解析器。

  • 将 CSV 文件加载到 DMatrix

    # label_column specifies the index of the column containing the true label
    dtrain = xgb.DMatrix('train.csv?format=csv&label_column=0')
    dtest = xgb.DMatrix('test.csv?format=csv&label_column=0')
    

    XGBoost 中的解析器功能有限。使用 Python 接口时,建议使用 pandas 的 read_csv 或其他类似工具,而非 XGBoost 内置的解析器。

XGBoost 各类函数支持的数据结构

标记

  • T:支持。

  • F:不支持。

  • NE:用例的无效类型。例如,pd.Series 不能作为多目标标签。

  • NPA:借助 numpy 数组支持。

  • AT:借助 arrow table 支持。

  • CPA:借助 cupy 数组支持。

  • SciCSR:借助 scripy 稀疏 CSR 支持。转换为 scipy CSR 可能可行也可能不可行。如果转换失败,将引发类型错误。

  • FF:如果请求,我们期待在近期支持它。

  • empty:待填充。

表头

  • X 表示预测变量矩阵。

  • 元信息:标签、权重等。

  • 多标签:用于多目标的 2 维标签。

  • 其他:我们未在此明确列出的任何其他内容,包括 lildiabsr 等格式。XGBoost 将尝试将其转换为 scipy csr。

支持矩阵

名称

DMatrix X

QuantileDMatrix X

Sklearn X

元信息

原地预测

多标签

numpy.ndarray

T

T

T

T

T

T

scipy.sparse.csr

T

T

T

NE

T

F

scipy.sparse.csc

T

F

T

NE

F

F

scipy.sparse.coo

SciCSR

F

SciCSR

NE

F

F

uri

T

F

F

F

NE

F

list

NPA

NPA

NPA

NPA

NPA

T

tuple

NPA

NPA

NPA

NPA

NPA

T

pandas.DataFrame

NPA

NPA

NPA

NPA

NPA

NPA

pandas.Series

NPA

NPA

NPA

NPA

NPA

NE

cudf.DataFrame

T

T

T

T

T

T

cudf.Series

T

T

T

T

FF

NE

cupy.ndarray

T

T

T

T

T

T

torch.Tensor

T

T

T

T

T

T

dlpack

CPA

CPA

CPA

FF

FF

modin.DataFrame

NPA

FF

NPA

NPA

FF

modin.Series

NPA

FF

NPA

NPA

FF

pyarrow.Table

T

T

T

T

T

T

polars.DataFrame

AT

AT

AT

AT

AT

AT

polars.LazyFrame (警告)

AT

AT

AT

AT

AT

AT

polars.Series

AT

AT

AT

AT

AT

NE

__array__

NPA

F

NPA

NPA

H

其他

SciCSR

F

F

F

polars LazyFrame.collect 支持多种配置,包括查询引擎的选择和类型强制转换。XGBoost 仅使用默认参数。请在将其传递给 XGBoost 之前运行 collect 以获取 DataFrame,从而更好地控制行为。

设置参数

XGBoost 可以使用列表对或字典来设置 参数。例如

  • Booster 参数

    param = {'max_depth': 2, 'eta': 1, 'objective': 'binary:logistic'}
    param['nthread'] = 4
    param['eval_metric'] = 'auc'
    
  • 您还可以指定多个评估指标

    param['eval_metric'] = ['auc', 'ams@0']
    
    # alternatively:
    # plst = param.items()
    # plst += [('eval_metric', 'ams@0')]
    
  • 指定验证集以观察性能

    evallist = [(dtrain, 'train'), (dtest, 'eval')]
    

训练

训练模型需要参数列表和数据集。

num_round = 10
bst = xgb.train(param, dtrain, num_round, evallist)

训练后,模型可以保存。

bst.save_model('0001.model')

模型及其特征映射也可以转储到文本文件。

# dump model
bst.dump_model('dump.raw.txt')
# dump model with feature map
bst.dump_model('dump.raw.txt', 'featmap.txt')

已保存的模型可以按如下方式加载

bst = xgb.Booster({'nthread': 4})  # init model
bst.load_model('model.bin')  # load model data

xgboost.Booster 中的 updateboost 等方法仅用于内部使用。包装函数 xgboost.train 执行一些预配置,包括设置缓存和一些其他参数。

早停

如果您有验证集,可以使用早停来找到最优的 boosting 轮数。早停至少需要 evals 中有一个集合。如果多于一个,它将使用最后一个。

train(..., evals=evals, early_stopping_rounds=10)

模型将训练直到验证分数不再提高。验证错误需要每 early_stopping_rounds 轮至少下降一次才能继续训练。

如果发生早停,模型将有两个额外的字段:bst.best_score, bst.best_iteration。请注意,xgboost.train() 将返回最后一轮的模型,而不是最优的模型。

这适用于需要最小化的指标(RMSE, log loss 等)和需要最大化的指标(MAP, NDCG, AUC)。请注意,如果您指定了多个评估指标,param['eval_metric'] 中的最后一个指标将用于早停。

预测

训练或加载的模型可以在数据集上执行预测。

# 7 entities, each contains 10 features
data = np.random.rand(7, 10)
dtest = xgb.DMatrix(data)
ypred = bst.predict(dtest)

如果训练期间启用了早停,您可以使用 bst.best_iteration 从最优迭代获取预测结果。

ypred = bst.predict(dtest, iteration_range=(0, bst.best_iteration + 1))

绘图

您可以使用绘图模块来绘制重要性图和输出树。

要绘制重要性图,请使用 xgboost.plot_importance()。此函数需要安装 matplotlib

xgb.plot_importance(bst)

要通过 matplotlib 绘制输出树,请使用 xgboost.plot_tree(),并指定目标树的序号。此函数需要 graphvizmatplotlib

xgb.plot_tree(bst, num_trees=2)

使用 IPython 时,可以使用 xgboost.to_graphviz() 函数,该函数将目标树转换为 graphviz 实例。graphviz 实例会在 IPython 中自动渲染。

xgb.to_graphviz(bst, num_trees=2)

Scikit-Learn 接口

XGBoost 为一些预定义的模型(包括回归、分类和排序)提供了易于使用的 scikit-learn 接口。更多信息请参阅 使用 Scikit-Learn 估计器接口

# Use "hist" for training the model.
reg = xgb.XGBRegressor(tree_method="hist", device="cuda")
# Fit the model using predictor X and response y.
reg.fit(X, y)
# Save model into JSON format.
reg.save_model("regressor.json")

用户在需要时仍然可以访问底层的 booster 模型

booster: xgb.Booster = reg.get_booster()